叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
序自序自序杂症大小合参凡例（小引）杂症大小合参凡例痘疹全集凡例杂症痘疹药性主治合参凡例杂症大小合参卷首上 内经纂要上古天真论篇四气调神大论篇生气通天论篇金匮真言论篇阴阳应象大论篇阴阳离合论篇阴阳别论
黄帝素问宣明论方
保养生胎论妇人劳伤偏郁忧思食积论男女尺脉盛弱妇人受胎妇人经水不调血虚白带崩漏安胎
简介卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十
脉学阐微
自叙凡例白喉证论辩证法辨脉法用药法白喉热证尚轻治法白喉热证渐重治法白喉寒证尚轻治法白喉寒证渐重治法白喉虚热证治法白喉虚寒证治法白喉寒热错杂证治法续方白喉误治坏证治法白喉愈后补虚治法妇人白喉证小儿白喉证
序凡例原叙卷首诊法五脏六腑经气望色闻声问证切脉卷一证治背上头骨两耳眼目唇口鼻孔齿牙舌本咽喉胸前大腹小腹胁肋腰中手臂脚腿前阴后阴大便小便卷二证治寒热呕吐咳嗽喘失血遗精言语心神斑黄出汗肿胀饮食起居倒仆掣动
和序廉序吴序罗序自序卷上决证诗赋观形气及幼攻补戒毁同道为医先去贪嗔辨证早决安危五色主病诊脉明证议金银薄荷胎寒藏寒胎热弄舌舒舌脐风脐突夜啼急惊天钓急惊后如疟慢惊搐证诸风毒破血伤风伤积惊积诸热吐泻伤寒伤风
卷上太阳方总论卷下阳明方总论少阳方总论太阴方总论少阴方总论厥阴方总论六经方余论