卷第一玉石部玉屑车渠金线矾波斯白矾金屑银屑石流黄绿盐紫骐竭珊瑚石蟹胡桐泪卷第二草部人参木香草犀根薇白兔藿无风独摇草人肝藤石海根越王余通草兜纳香风延母大瓠藤水海藻昆布阿魏荜茇酱延胡索红豆蔻肉豆蔻零陵香补
兰室秘藏
《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
序自记第一种一览延龄一卷第二种橘旁杂论上卷古今医书大意不为良相愿为良医为人子者不可不知医方技中医术为要脉四时受病原委六淫相兼说用药如用兵医不尽药石治贵人有四难医家五失七情皆听命于心再论七情总由心发人病
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
洄溪医案
柳选四家医案
叙正文跋
自序卷一证治总论气血精神论升降出入论承制生化论虚实补泻论卷二上形气类三阴三阳名义一三阴三阳名义二三阴三阳名义三高骨大骨非一骨也三焦水道膀胱津液论饮入于胃游溢精气上输于脾脾气散精上归于肺通调水道下输膀胱
叙四诊初生门惊风门痫证门疳证门呕吐门泻证门感冒风寒门瘟疫门暑证门霍乱门痢疾门疟疾门咳嗽门喘证门痰证门疝证门淋证门头痛门腹痛门黄胆门水肿门腹胀门发热门癖疾门汗证门失血门杂证门幼科证治汇方