序卷上定尺寸法点灸法下火法用火法候天色法定灸多少法定发际法发灸疮法淋洗灸疮法贴灸疮法人神所在不宜针灸每月忌日不宜针灸出血十二部人神不宜灸十二时忌不宜灸十二部年人神不宜灸九部旁通人神不宜灸杂忌旁通不宜灸
第1部分第2部分第3部分
卷上卷下
序卷之一头目卷之二耳鼻舌卷之三口面项喉卷之四心神卷之五胸腹卷之六身卷之七背手足卷之八溺孔肛门
序题辞凡例总论第一延医法论第二表论第三里论第四寒论第五热论第六虚论第七实论第八辨惊风之误论第九不可饿论第十治痘论第十一治疹论第十二
养生随笔
自序再自序合论诸书之得失以示初学之从违（四条）论读医书之难论诊病须知四诊论《景岳全书》论金匮肾气汤论倪涵初先生疟痢三方附录王子圣大归芍汤张洁古芍药汤附论噤口痢论吴又可《温疫论》（四条）论时邪论初诊用药
简介普济方有关说明卷一 方脉总论 辨男女形生神毓论卷二 方脉总论 辨奇经八脉法卷三 方脉总论 辨七表八里脉法卷四 方脉总论 九道病脉卷五 方脉药性总论 药性总论卷六 五运六气图卷七 运气图 甲子岁图卷
伤寒兼证析义
仁斋直指方论